Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNP16150 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNP16150 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNP16150 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNP16150 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPNP16150 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPNP16150 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPNP16150 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNP16150 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNP16150 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNP16150 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNP16150 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNP16150 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNP16150 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNP16150 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNP16150 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNP16150 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNP16150 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNP16150 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNP16150 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNP16150 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNP16150 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNP16150 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNP16150 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNP16150 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNP16150 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNP16150 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPNP16150 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNP16150 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPNP16150 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPNP16150 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPNP16150 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPNP16150 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPNP16150 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPNP16150 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPNP16150 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPNP16150 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPNP16150 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPNP16150 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms