Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GSPT1P15170 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSPT1P15170 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms