Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRG2P13727 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRG2P13727 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRG2P13727 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRG2P13727 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRG2P13727 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRG2P13727 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRG2P13727 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRG2P13727 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRG2P13727 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRG2P13727 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRG2P13727 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRG2P13727 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRG2P13727 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRG2P13727 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRG2P13727 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRG2P13727 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRG2P13727 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRG2P13727 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRG2P13727 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRG2P13727 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRG2P13727 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRG2P13727 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRG2P13727 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRG2P13727 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRG2P13727 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRG2P13727 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRG2P13727 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG2P13727 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG2P13727 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG2P13727 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG2P13727 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms