Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RLBP1P12271 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms