Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBL4AP11441 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL4AP11441 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBL4AP11441 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBL4AP11441 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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