Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-5P0DP03 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms