Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms