Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RD3LP0DJH9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms