Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC172P0C7W6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms