Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
C4AP0C0L4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
C4AP0C0L4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms