Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKMP08237 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKMP08237 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKMP08237 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKMP08237 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PFKMP08237 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PFKMP08237 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFKMP08237 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PFKMP08237 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFKMP08237 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKMP08237 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKMP08237 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKMP08237 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKMP08237 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKMP08237 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKMP08237 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKMP08237 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKMP08237 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKMP08237 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKMP08237 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKMP08237 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKMP08237 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKMP08237 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKMP08237 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKMP08237 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKMP08237 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKMP08237 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFKMP08237 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PFKMP08237 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFKMP08237 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFKMP08237 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFKMP08237 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFKMP08237 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PFKMP08237 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFKMP08237 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFKMP08237 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFKMP08237 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PFKMP08237 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PFKMP08237 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFKMP08237 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PFKMP08237 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFKMP08237 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKMP08237 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKMP08237 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKMP08237 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKMP08237 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKMP08237 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKMP08237 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKMP08237 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKMP08237 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFKMP08237 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFKMP08237 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PFKMP08237 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFKMP08237 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFKMP08237 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFKMP08237 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PFKMP08237 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PFKMP08237 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PFKMP08237 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PFKMP08237 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PFKMP08237 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms