Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYCNP04198 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYCNP04198 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYCNP04198 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYCNP04198 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYCNP04198 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYCNP04198 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYCNP04198 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYCNP04198 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MYCNP04198 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MYCNP04198 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYCNP04198 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYCNP04198 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYCNP04198 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYCNP04198 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYCNP04198 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYCNP04198 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYCNP04198 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYCNP04198 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MYCNP04198 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYCNP04198 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYCNP04198 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYCNP04198 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYCNP04198 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYCNP04198 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYCNP04198 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYCNP04198 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYCNP04198 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYCNP04198 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYCNP04198 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYCNP04198 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYCNP04198 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYCNP04198 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYCNP04198 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYCNP04198 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYCNP04198 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYCNP04198 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYCNP04198 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYCNP04198 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYCNP04198 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYCNP04198 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYCNP04198 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MYCNP04198 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYCNP04198 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYCNP04198 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYCNP04198 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYCNP04198 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYCNP04198 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYCNP04198 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYCNP04198 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MYCNP04198 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCNP04198 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCNP04198 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCNP04198 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCNP04198 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCNP04198 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCNP04198 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCNP04198 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCNP04198 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYCNP04198 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYCNP04198 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYCNP04198 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MYCNP04198 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYCNP04198 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYCNP04198 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYCNP04198 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYCNP04198 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYCNP04198 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MYCNP04198 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MYCNP04198 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYCNP04198 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYCNP04198 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MYCNP04198 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCNP04198 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCNP04198 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCNP04198 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCNP04198 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCNP04198 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCNP04198 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCNP04198 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCNP04198 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCNP04198 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCNP04198 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCNP04198 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCNP04198 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCNP04198 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCNP04198 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCNP04198 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYCNP04198 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MYCNP04198 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYCNP04198 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYCNP04198 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYCNP04198 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYCNP04198 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYCNP04198 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYCNP04198 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYCNP04198 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYCNP04198 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYCNP04198 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYCNP04198 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms