Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01737 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01737 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01737 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
P01737 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01737 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01737 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01737 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01737 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01737 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01737 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01737 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01737 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01737 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01737 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01737 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01737 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01737 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01737 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01737 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01737 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01737 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01737 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01737 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
P01737 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01737 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01737 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01737 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01737 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01737 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01737 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01737 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01737 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
P01737 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
P01737 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms