Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-17P01599 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms