Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNAP29O95721 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SNAP29O95721 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms