Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACSL3O95573 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms