Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNUPNO95149 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNUPNO95149 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms