Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOBTB3O94955 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RHOBTB3O94955 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms