Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP72O76094 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP72O76094 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP72O76094 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP72O76094 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP72O76094 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP72O76094 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP72O76094 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP72O76094 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP72O76094 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP72O76094 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP72O76094 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP72O76094 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP72O76094 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP72O76094 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP72O76094 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP72O76094 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP72O76094 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP72O76094 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP72O76094 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP72O76094 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP72O76094 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP72O76094 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP72O76094 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP72O76094 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP72O76094 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP72O76094 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP72O76094 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP72O76094 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP72O76094 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP72O76094 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP72O76094 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP72O76094 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP72O76094 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP72O76094 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP72O76094 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP72O76094 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP72O76094 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP72O76094 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP72O76094 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP72O76094 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP72O76094 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP72O76094 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP72O76094 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP72O76094 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP72O76094 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP72O76094 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP72O76094 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP72O76094 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP72O76094 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP72O76094 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP72O76094 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP72O76094 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP72O76094 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP72O76094 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP72O76094 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP72O76094 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP72O76094 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP72O76094 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP72O76094 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP72O76094 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP72O76094 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP72O76094 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP72O76094 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRP72O76094 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP72O76094 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP72O76094 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms