Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.025e-8■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NEK9-209ENST00000556170 3975 ntTSL 514.9□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MUS81-216ENST00000533519 694 ntTSL 214.88□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 FBRS-206ENST00000494101 2782 ntTSL 214.87□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NPEPPS-207ENST00000526247 678 ntTSL 314.86□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATG16L2-210ENST00000537837 784 ntTSL 514.72□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LIN37-202ENST00000587108 1407 ntTSL 514.72□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BCAS3-219ENST00000588569 875 ntTSL 314.68□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CLSTN3-205ENST00000535452 533 ntTSL 414.66□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRPF19-206ENST00000541371 943 ntTSL 314.62□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NCEH1-202ENST00000424772 921 ntTSL 214.55□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 414.47□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CEP250-204ENST00000422671 2648 ntTSL 514.44□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 KDM2B-213ENST00000541511 528 ntTSL 414.43□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 RPS3A-207ENST00000508783 587 ntTSL 314.43□□□□□ -0.12e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 DDX11-210ENST00000537136 482 ntTSL 414.43□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TTC28-AS1-204ENST00000424161 556 ntTSL 414.43□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NPEPPS-208ENST00000527298 1569 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TMED3-205ENST00000558562 938 ntTSL 214.41□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PSD4-204ENST00000418251 5600 ntTSL 514.35□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TTC28-AS1-217ENST00000452612 746 ntTSL 314.34□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC35B1-205ENST00000503334 943 ntTSL 314.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CRYBB2P1-201ENST00000354451 1560 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.143e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TTC28-AS1-211ENST00000430853 564 ntTSL 414.15□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 ZNF341-203ENST00000483118 3232 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SPRED3-203ENST00000586958 478 ntTSL 214□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TANGO6-210ENST00000568361 622 ntTSL 213.98□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYEOV-211ENST00000544008 599 ntTSL 213.98□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 FAXDC2-203ENST00000517448 948 ntTSL 213.92□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC25A11-205ENST00000576951 893 ntTSL 513.84□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)13.84□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.233e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SGK2-202ENST00000373077 1736 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.233e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GPR107-204ENST00000415344 648 ntTSL 313.54□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CCDC85C-202ENST00000554877 543 ntTSL 413.51□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATP5H-205ENST00000582341 979 ntTSL 213.46□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TANGO6-205ENST00000562000 542 ntTSL 413.46□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PPP1R3E-203ENST00000559314 2351 ntTSL 213.42□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PLP2-201ENST00000376322 620 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CALN1-206ENST00000446128 550 ntTSL 413.38□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYO18A-221ENST00000590242 637 ntTSL 213.37□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SGK2-209ENST00000496343 2395 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.283e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NFYC-219ENST00000496608 1965 ntTSL 213.24□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AD000671.1-201ENST00000591613 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TTC28-AS1-218ENST00000453632 562 ntTSL 413.18□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SPIDR-219ENST00000522321 760 ntTSL 413.17□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 NPEPPS-213ENST00000528751 558 ntTSL 413.13□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MAP3K14-AS1-201ENST00000585346 488 ntTSL 313.11□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CLSTN3-211ENST00000541667 671 ntTSL 412.98□□□□□ -0.333e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LIG3-213ENST00000590630 904 ntTSL 512.95□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CLSTN3-209ENST00000539982 570 ntTSL 412.93□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LIG3-207ENST00000586119 565 ntTSL 312.84□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 206.8
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