Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F6O75461 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F6O75461 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F6O75461 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F6O75461 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F6O75461 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F6O75461 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F6O75461 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F6O75461 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F6O75461 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F6O75461 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F6O75461 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F6O75461 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F6O75461 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F6O75461 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F6O75461 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F6O75461 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F6O75461 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F6O75461 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F6O75461 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F6O75461 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F6O75461 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F6O75461 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F6O75461 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F6O75461 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F6O75461 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F6O75461 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F6O75461 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F6O75461 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F6O75461 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F6O75461 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F6O75461 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F6O75461 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F6O75461 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F6O75461 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F6O75461 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms