Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH4O75427 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms