Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT3O75175 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms