Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMDSO60547 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMDSO60547 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMDSO60547 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMDSO60547 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMDSO60547 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMDSO60547 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GMDSO60547 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMDSO60547 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMDSO60547 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMDSO60547 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMDSO60547 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GMDSO60547 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GMDSO60547 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GMDSO60547 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GMDSO60547 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GMDSO60547 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GMDSO60547 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GMDSO60547 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GMDSO60547 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GMDSO60547 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GMDSO60547 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GMDSO60547 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GMDSO60547 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GMDSO60547 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GMDSO60547 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GMDSO60547 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GMDSO60547 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GMDSO60547 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GMDSO60547 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GMDSO60547 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GMDSO60547 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GMDSO60547 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GMDSO60547 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GMDSO60547 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GMDSO60547 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GMDSO60547 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GMDSO60547 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GMDSO60547 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GMDSO60547 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GMDSO60547 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GMDSO60547 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GMDSO60547 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GMDSO60547 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GMDSO60547 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GMDSO60547 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GMDSO60547 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GMDSO60547 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GMDSO60547 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GMDSO60547 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GMDSO60547 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GMDSO60547 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GMDSO60547 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GMDSO60547 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GMDSO60547 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GMDSO60547 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GMDSO60547 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GMDSO60547 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GMDSO60547 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GMDSO60547 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GMDSO60547 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GMDSO60547 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GMDSO60547 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GMDSO60547 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GMDSO60547 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GMDSO60547 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GMDSO60547 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GMDSO60547 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GMDSO60547 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GMDSO60547 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms