Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KIAA0556O60303 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
KIAA0556O60303 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
KIAA0556O60303 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms