Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDH7O60245 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH7O60245 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms