Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROM1O43490 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROM1O43490 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROM1O43490 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROM1O43490 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROM1O43490 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM1O43490 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM1O43490 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM1O43490 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM1O43490 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM1O43490 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM1O43490 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM1O43490 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM1O43490 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM1O43490 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM1O43490 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM1O43490 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM1O43490 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM1O43490 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM1O43490 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM1O43490 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM1O43490 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM1O43490 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM1O43490 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM1O43490 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM1O43490 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM1O43490 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM1O43490 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM1O43490 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROM1O43490 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROM1O43490 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROM1O43490 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROM1O43490 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROM1O43490 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROM1O43490 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROM1O43490 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROM1O43490 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROM1O43490 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROM1O43490 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROM1O43490 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROM1O43490 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROM1O43490 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROM1O43490 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROM1O43490 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROM1O43490 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PROM1O43490 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROM1O43490 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROM1O43490 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROM1O43490 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROM1O43490 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROM1O43490 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROM1O43490 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROM1O43490 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROM1O43490 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PROM1O43490 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROM1O43490 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROM1O43490 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROM1O43490 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROM1O43490 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROM1O43490 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROM1O43490 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROM1O43490 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms