Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK2O43353 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK2O43353 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms