Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP2O15127 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP2O15127 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms