Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2LO15068 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms