Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLGNO14967 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLGNO14967 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLGNO14967 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLGNO14967 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLGNO14967 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLGNO14967 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLGNO14967 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLGNO14967 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLGNO14967 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLGNO14967 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLGNO14967 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLGNO14967 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLGNO14967 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLGNO14967 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLGNO14967 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLGNO14967 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLGNO14967 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLGNO14967 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLGNO14967 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLGNO14967 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLGNO14967 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLGNO14967 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLGNO14967 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLGNO14967 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLGNO14967 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLGNO14967 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLGNO14967 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLGNO14967 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLGNO14967 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLGNO14967 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLGNO14967 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLGNO14967 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLGNO14967 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLGNO14967 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLGNO14967 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLGNO14967 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLGNO14967 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLGNO14967 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLGNO14967 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLGNO14967 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLGNO14967 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLGNO14967 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLGNO14967 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLGNO14967 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLGNO14967 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLGNO14967 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLGNO14967 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLGNO14967 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLGNO14967 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLGNO14967 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLGNO14967 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLGNO14967 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLGNO14967 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLGNO14967 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLGNO14967 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLGNO14967 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLGNO14967 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLGNO14967 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms