Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRTO14522 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRTO14522 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRTO14522 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
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