Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
O00370 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
O00370 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
O00370 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
O00370 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
O00370 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
O00370 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
O00370 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
O00370 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
O00370 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
O00370 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
O00370 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
O00370 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
O00370 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
O00370 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
O00370 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
O00370 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
O00370 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
O00370 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
O00370 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
O00370 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
O00370 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
O00370 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
O00370 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
O00370 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
O00370 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
O00370 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
O00370 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
O00370 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
O00370 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
O00370 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
O00370 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
O00370 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
O00370 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
O00370 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
O00370 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
O00370 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
O00370 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
O00370 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
O00370 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
O00370 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
O00370 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
O00370 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
O00370 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
O00370 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
O00370 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
O00370 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
O00370 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
O00370 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
O00370 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
O00370 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
O00370 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
O00370 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
O00370 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
O00370 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
O00370 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
O00370 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
O00370 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
O00370 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
O00370 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
O00370 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
O00370 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
O00370 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
O00370 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
O00370 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
O00370 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
O00370 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
O00370 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
O00370 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
O00370 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
O00370 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
O00370 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
O00370 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
O00370 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
O00370 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
O00370 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
O00370 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
O00370 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
O00370 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
O00370 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
O00370 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms