Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A1O00337 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms