Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC169A6NNP5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC169A6NNP5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms