Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NL46 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NL46 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NL46 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NL46 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NL46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NL46 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NL46 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A6NL46 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A6NL46 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A6NL46 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A6NL46 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A6NL46 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A6NL46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A6NL46 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A6NL46 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A6NL46 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A6NL46 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A6NL46 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A6NL46 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A6NL46 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A6NL46 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A6NL46 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A6NL46 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
A6NL46 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A6NL46 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A6NL46 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A6NL46 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A6NL46 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A6NL46 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A6NL46 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A6NL46 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A6NL46 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A6NL46 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A6NL46 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A6NL46 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A6NL46 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A6NL46 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A6NL46 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A6NL46 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A6NL46 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A6NL46 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A6NL46 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A6NL46 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A6NL46 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A6NL46 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A6NL46 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A6NL46 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A6NL46 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A6NL46 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A6NL46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A6NL46 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A6NL46 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A6NL46 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
A6NL46 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A6NL46 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A6NL46 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A6NL46 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A6NL46 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A6NL46 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NL46 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A6NL46 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A6NL46 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A6NL46 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A6NL46 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A6NL46 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A6NL46 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NL46 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NL46 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NL46 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms