Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR42E2A6NKP2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms