Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC78A2IDD5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms