Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A0U1RQJ8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms