Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087X1B8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms