Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms