Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms