Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms