Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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ZNF248Q8NDW4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ZNF248Q8NDW4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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ZNF248Q8NDW4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ZNF248Q8NDW4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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ZNF248Q8NDW4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ZNF248Q8NDW4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ZNF248Q8NDW4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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ZNF248Q8NDW4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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