Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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