Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms