Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PXDC1Q5TGL8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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