Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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