Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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