Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GOLGA4Q13439 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA4Q13439 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms